ใช้เป็นยาปฏิชีวนะในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะเชื้อแกรมบวก เช่น Staphylococcus aureus แม้จะไม่ค่อยใช้ในมนุษย์แล้วเนื่องจากมีผลข้างเคียงและมีทางเลือกอื่นที่ดีกว่า แต่ยังมีการใช้ในงานวิจัยทางชีววิทยา เช่น การศึกษาบทบาทของโปรตีน Hsp90 เนื่องจากโนโวไบโอซินสามารถยับยั้งการทำงานของโปรตีนดังกล่าวได้ จึงถูกนำมาใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษาเส้นทางการส่งสัญญาณในเซลล์และการควบคุมการพับโปรตีน