อิสโซพรีนเป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการผลิตยางสังเคราะห์ โดยเฉพาะยางโพลีไอโซพรีน ซึ่งใช้ในอุตสาหกรรมยางล้อรถยนต์ ยางในอุปกรณ์อุตสาหกรรม และผลิตภัณฑ์ยางอื่นๆ ที่ต้องการความยืดหยุ่นและทนต่อการสึกหรอ นอกจากนี้ อิสโซพรีนยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ เช่น เทอร์พีน และสารประกอบในกลุ่มไอโซพรีนอยด์ ที่มีการนำไปใช้ในอุตสาหกรรมยา น้ำหอม และผลิตภัณฑ์ดูแลส่วนบุคคล ด้วยคุณสมบัติที่ทำให้สามารถสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนได้ อิสโซพรีนจึงมีบทบาทสำคัญในงานวิจัยและพัฒนาสารชีวภาพใหม่ๆ