ฟลูออรันเธนถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ เช่น การผลิตทรานซิสเตอร์หรือเซลล์แสงอาทิตย์อินทรีย์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นมาตรวัดในการศึกษาการปนเปื้อนของสารโพลีไซคลิกอะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน (PAHs) ในสิ่งแวดล้อม โดยเฉพาะในดิน น้ำ และตะกอน เนื่องจากมีความคงตัวและสามารถสะสมในสิ่งมีชีวิตได้ ทำให้ใช้ติดตามแหล่งกำเนิดของมลพิษจากกิจกรรมของมนุษย์ เช่น การเผาไหม้เชื้อเพลิงฟอสซิลและการเผาขยะ