ใช้คริสตัลไวโอเลตในด้านต่าง ๆ หลายประการ โดยเฉพาะในทางการแพทย์และอุตสาหกรรม นิยมใช้เป็นสีย้อมในห้องปฏิบัติการทางจุลชีววิทยา เช่น การย้อมแบคทีเรียตามวิธีแกรม (Gram staining) ซึ่งช่วยแยกแยะชนิดของแบคทีเรียได้ตามโครงสร้างผนังเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมสิ่งทอและกระดาษเพื่อให้สีม่วงเข้ม รวมถึงใช้ในผลิตภัณฑ์เครื่องสำอางและสีทาบางชนิด แต่เนื่องจากมีความเป็นพิษและอาจก่อมะเร็ง จึงมีการควบคุมการใช้ในผลิตภัณฑ์ที่สัมผัสผิวหนังหรือใช้ในอาหาร ในภาคการประมง เคยใช้คริสตัลไวโอเลตเป็นยาฆ่าเชื้อหรือรักษาโรคปลา แต่ปัจจุบันถูกห้ามใช้ในหลายประเทศเนื่องจากตกค้างในเนื้อปลาและเป็นอันตรายต่อมนุษย์