ใช้คริสตัลไวโอเลตในด้านต่าง ๆ หลายประการ โดยเฉพาะในทางการแพทย์และอุตสาหกรรมสี ใช้เป็นยาฆ่าเชื้อโรคง่าย ๆ สำหรับบาดแผลตื้น โดยเฉพาะในสัตว์น้ำ เช่น การเลี้ยงปลา ซึ่งช่วยป้องกันเชื้อราและแบคทีเรีย นิยมใช้รักษาโรคเช่น ราที่ผิวหนังหรือโรคขาวน้ำในปลา ในห้องปฏิบัติการ คริสตัลไวโอเลตใช้เป็นสีย้อมในการย้อมแบคทีเรีย โดยเฉพาะในวิธีการย้อมแกรม (Gram staining) เพื่อช่วยแยกประเภทแบคทีเรียออกเป็นแกรมบวกและแกรมลบ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมสิ่งทอและกระดาษเป็นสีแต่งแต้ม เนื่องจากให้สีม่วงสดใสและติดดี อย่างไรก็ตาม มีข้อควรระวังเรื่องพิษและศักยภาพในการก่อมะเร็ง จึงมีการควบคุมการใช้ในผลิตภัณฑ์บางประเภท โดยเฉพาะในอาหารหรือเครื่องสำอาง