ใช้คริสตัลไวโอเลตในด้านต่าง ๆ หลายประการ โดยเฉพาะในทางการแพทย์และอุตสาหกรรม ใช้เป็นสีย้อมในห้องปฏิบัติการทางจุลชีววิทยา เช่น ใช้ในการย้อมแบคทีเรียตามวิธีแกรม (Gram staining) เพื่อช่วยแยกประเภทแบคทีเรียออกเป็นแกรมบวกและแกรมลบ นอกจากนี้ คริสตัลไวโอเลตยังมีคุณสมบัติต้านเชื้อแบคทีเรียและเชื้อรา จึงถูกใช้ในยาทาแผล ยาสำหรับรักษาเชื้อราในปลา หรือในสัตว์น้ำเลี้ยง เช่น ปลานิล หรือกุ้ง เพื่อป้องกันการติดเชื้อราหรือแบคทีเรีย ในอุตสาหกรรม สีย้อมนี้ใช้ในการย้อมผ้า กระดาษ และหนัง รวมถึงใช้ในหมึกพิมพ์และสีต่าง ๆ อย่างไรก็ตาม คริสตัลไวโอเลตมีศักยภาพเป็นสารก่อมะเร็ง จึงมีการควบคุมการใช้งานในผลิตภัณฑ์ที่สัมผัสกับมนุษย์โดยตรง โดยเฉพาะในเครื่องสำอางหรือผลิตภัณฑ์ที่ใช้กับผิวหนังเป็นเวลานาน