ใช้คริสตัลไวโอเลตในด้านต่าง ๆ หลายประการ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมสิ่งทอและกระดาษ ซึ่งทำหน้าที่เป็นสีย้อมให้สีม่วงสดใส นิยมใช้ย้อมผ้าฝ้าย ผ้าลินิน และกระดาษ นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการทางชีววิทยาและจุลชีววิทยาเป็นตัวย้อมสำหรับการตรวจหาแบคทีเรีย โดยเฉพาะในการย้อมแกรม (Gram staining) ซึ่งช่วยแยกแยะแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบ ในด้านการแพทย์ เคยใช้คริสตัลไวโอเลตเป็นสารฆ่าเชื้อโรคเบื้องต้นสำหรับบาดแผลตื้น และใช้รักษาเชื้อราบางชนิด โดยเฉพาะในสัตว์น้ำ เช่น การรักษาโรคเชื้อราในปลา อย่างไรก็ตาม ปัจจุบันมีข้อจำกัดในการใช้เนื่องจากมีความเป็นพิษและอาจก่อมะเร็งได้ จึงมีการควบคุมการใช้อย่างเข้มงวดในผลิตภัณฑ์ที่เกี่ยวข้องกับมนุษย์