ใช้สารละลายมาตรฐานกรดทริฟลูออโรแอซีติก (TFA) เป็นตัวทำละลายในกระบวนการวิเคราะห์ด้วยเทคนิคไฮเพอร์ฟอร์แมนซ์ ลิควิด โครมาโตกราฟี (HPLC) โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการแยกและวิเคราะห์สารชีวโมเลกุล เช่น เปปไทด์และโปรตีน เนื่องจาก TFA ช่วยเพิ่มความละเอียดในการแยกสารในเฟสผกผัน (reversed-phase) โดยทำหน้าที่เป็นไอออนปาร์ร์ (ion-pairing agent) ที่ช่วยควบคุมการเคลื่อนที่ของสารที่มีประจุ นอกจากนี้ยังใช้เป็นมาตรฐานในการสอบเทียบหรือควบคุมคุณภาพในห้องปฏิบัติการวิเคราะห์ เพื่อให้มั่นใจว่าผลการวิเคราะห์มีความแม่นยำและสามารถทำซ้ำได้ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม ชีววิทยาโมเลกุล และการพัฒนายา โดยเฉพาะในขั้นตอนการบริสุทธิ์และการตรวจสอบความบริสุทธิ์ของสาร