ใช้สารละลายมาตรฐานของกรดไตรฟลูออโรแอซีติก (TFA) เป็นตัวทำละลายในกระบวนการวิเคราะห์ด้วยเทคนิค HPLC โดยเฉพาะอย่างยิ่งในงานแยกสารชีวโมเลกุล เช่น เปปไทด์และโปรตีน เนื่องจาก TFA ช่วยเพิ่มความละเอียดในการแยกสารได้ดีในระบบย้อนกลับ (reversed-phase) นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารเติมแต่งในเฟสเคลื่อนที่เพื่อควบคุมค่าพีเอชและป้องกันการยึดติดของสารวิเคราะห์กับคอลัมน์ ทำให้ผลการวิเคราะห์มีความแม่นยำและซ้ำผลได้ดี เหมาะสำหรับห้องปฏิบัติการที่ต้องการความถูกต้องสูงในการวิเคราะห์สารชีวภาพและสารอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน