กรดไตรคลอโรอะซติกถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในวงการแพทย์สำหรับการรักษาผิวหนัง โดยเฉพาะในเคมีลอกผิวเพื่อกำจัดหูด รอยสัก และรอยโรคผิวหนังบางชนิด มันทำหน้าที่เป็นสารกัดกร่อนที่ทำลายเนื้อเยื่อที่ไม่ต้องการโดยการทำให้โปรตีนเสียสภาพ ในชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล ใช้ในการตกตะกอน макромолекулы เช่น โปรตีนและดีเอ็นเอ เพื่อช่วยในการแยกและทำให้บริสุทธิ์ นอกจากนี้ ยังใช้เป็นสารยึดเกาะในฮิสโตโลยีสำหรับการเก็บรักษาตัวอย่างเนื้อเยื่อ ในเกษตรกรรม ใช้เป็นสารกำจัดวัชพืชสำหรับควบคุมวัชพืชใบกว้างในพืชผล คุณสมบัติกรดที่แรงยังทำให้มีประโยชน์ในเคมีวิเคราะห์สำหรับการไทเทรชันและการวิเคราะห์เคมีต่างๆ ในอุตสาหกรรม ใช้ในการผลิตสารเคมีอื่นๆ และเป็นส่วนประกอบในกระบวนการฟอกหนังและทำความสะอาดพื้นผิวโลหะ