เมทิลซัลไฟด์ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอาหารเป็นสารแต่งกลิ่นรส โดยให้กลิ่นเฉพาะตัวที่คล้ายกับกะหล่ำปลีสุกหรือข้าวโพด นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะในการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและสารกำจัดวัชพืช ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญ ในอุตสาหกรรมปิโตรเลียม เมทิลซัลไฟด์ถูกใช้เป็นสารเติมกลิ่นในก๊าซเพื่อตรวจจับการรั่วไหล เนื่องจากมีกลิ่นแรงและโดดเด่น นอกจากนี้ เมทิลซัลไฟด์ยังมีบทบาทในการศึกษาสิ่งแวดล้อมเป็นตัวบ่งชี้สำหรับกระบวนการทางชีวภาพบางอย่าง เช่น กิจกรรมของจุลินทรีย์ในระบบนิเวศทางทะเล การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงภาคเภสัชกรรม ซึ่งใช้ในการสังเคราะห์ยาบางชนิดและส่วนประกอบยาสำคัญ