ควินโตเซนใช้หลักในการเป็นสารกำจัดเชื้อราในดินเพื่อปกป้องพืชผลจากโรคเชื้อรา ช่วยควบคุมโรคต่าง ๆ เช่น โรคชะงักงอก โรครากเน่า และการเน่าเปื่อยของเมล็ดพันธุ์ในพืชเกษตรและสวนต่างๆ นอกจากนี้ยังใช้ควบคุมการเจริญเติบโตของเชื้อราในพืชประดับและหญ้าตกแต่ง ควินโตเซนยังถูกนำมาใช้เป็นสารกันเชื้อราในไม้เพื่อป้องกันการเน่าเปื่อยจากเชื้อราในเนื้อไม้และผลิตภัณฑ์ไม้ คุณสมบัติต้านเชื้อรากว้างช่วยให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการรักษาสุขภาพพืชและป้องกันความเสียหายจากเชื้อราในวัสดุ อย่างไรก็ตาม ควรใช้ด้วยความระมัดระวังเนื่องจากอาจมีผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมและสุขภาพ