ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาเกี่ยวกับระบบประสาทส่วนกลาง เป็นโครงสร้างพื้นฐานสำหรับโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากมีทั้งหมู่เอมีนและคีโตน ซึ่งช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีได้หลากหลาย ใช้บ่อยในการเตรียมอนุพันธ์แบบวงแหวนของ gamma-aminobutyric acid (GABA) และสารประกอบที่เกี่ยวข้องกับการทำงานของระบบประสาท โครงสร้างไซโคลเพนเทนที่แข็งตัวช่วยในการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมในเคมีเภสัชกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษที่ต้องการเอมีนแบบ chiral