β-Guanidinopropionic acid ใช้หลักในการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับเมตาบอลิซึมของกล้ามเนื้อและการควบคุมพลังงาน โดยทำหน้าที่เป็นอนุภาคนาฬิกาครีเอทีน (creatine analog) ซึ่งยับยั้งการดูดซึมครีเอทีนในเซลล์กล้ามเนื้อแบบแข่งขัน คุณสมบัตินี้ทำให้มีคุณค่าต่อการตรวจสอบบทบาทของครีเอทีนในกระบวนการพลังงานของเซลล์ โดยเฉพาะในการศึกษาที่มุ่งเน้นไปที่ความเมื่อยล้าของกล้ามเนื้อ ความทนทาน และความผิดปกติทางเมตาบอลิซึม นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจในงานวิจัยก่อนคลินิกเพื่อทำความเข้าใจผลกระทบที่อาจเกิดขึ้นต่อภาวะเช่น กล้ามเนื้ออ่อนแรงแบบกล้ามเนื้อ (muscular dystrophy) และโรคระบบประสาทกล้ามเนื้ออื่นๆ ความสามารถในการปรับเปลี่ยนเมตาบอลิซึมพลังงานยังทำให้เป็นเครื่องมือสำหรับการศึกษากลไกทางเมตาบอลิซึมและผลกระทบต่อสุขภาพและโรค