ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง (solid-phase peptide synthesis) เนื่องจากกลุ่ม Fmoc ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน โดยไม่ทำลายพันธะอื่นในโมเลกุล ขณะที่กลุ่ม t-butyl ทำหน้าที่ป้องกันหมู่ไฮดรอกซิล ช่วยป้องกันการเกิดปฏิกิริยาข้างเคียงระหว่างการสังเคราะห์ ส่งผลให้ได้ผลิตภัณฑ์เปปไทด์บริสุทธิ์สูงและมีผลผลิตดี เหมาะสำหรับการสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน รวมถึงเปปไทด์ที่มีโครงสร้างเป็นลูปหรือมีความโค้งงอเฉพาะตัว เช่น เปปไทด์ที่เกี่ยวข้องกับการทำงานของโปรตีนหรือสารยับยั้งเอนไซม์