ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะหน่วยย่อยของกรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งช่วยให้สามารถทำการจับคู่แบบเลือกสรรได้และป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ กลุ่ม Boc ให้การป้องกันที่ละลายได้ในกรดสำหรับกลุ่มอะมีน ในขณะที่กรดคาร์บอกซิลิกสามารถถูกกระตุ้นเพื่อการก่อตัวพันธะอะไมด์ เหมาะสำหรับการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งและแบบสารละลายของเปปไทด์เชิงซ้อนและเปปไทด์เลียนแบบ นิยมใช้ในงานวิจัยเภสัชกรรมเพื่อพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพและผู้สมัครยา