L-Alanine benzyl ester p-toluenesulfonate salt ใช้หลักๆ ในงานสังเคราะห์อินทรีย์และเคมีเปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของ L-alanine ซึ่งกลุ่มเอสเตอร์เบนซิลช่วยปกป้องส่วน carboxyl ระหว่างปฏิกิริยาเคมี สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ ช่วยให้สามารถประกอบกรดอะมิโนได้อย่างควบคุมโดยป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารกลาง chiral สำหรับเภสัชภัณฑ์ โดย stereochemistry ของ L-alanine สำคัญต่อกิจกรรมทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ยังประยุกต์ใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษากลไกเอนไซม์และพัฒนาสาร bioactive ใหม่ๆ