สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้หลักๆ ในสาขาเคมียารักษาโรคและการวิจัยทางเภสัชภัณฑ์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะโมเลกุลที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่มเปอร์ฟลูออโรฟีนิลและกลุ่มอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบยาที่มีเสถียรภาพและการดูดซึมทางชีวภาพที่เพิ่มขึ้น

นักวิจัยมักใช้สารเคมีนี้ในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์หรือตัวปรับตัวรับสัญญาณ โดยที่ส่วนของกลุ่มเปอร์ฟลูออโรฟีนิลสามารถมีส่วนช่วยในการจับติดกับโปรตีนเป้าหมายได้อย่างแข็งแกร่ง นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการเตรียมเพปไทด์มิมิติก ซึ่งเป็นสารประกอบที่เลียนแบบโครงสร้างและหน้าที่ของเปปไทด์แต่มีเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึมที่ดีขึ้น

การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปถึงการศึกษาสารประกอบฟลูออรีน ซึ่งมีความน่าสนใจเนื่องจากคุณสมบัติทางกายภาพและเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ เช่น ความชอบน้ำมันที่เพิ่มขึ้นและความต้านทานต่อการย่อยสลายทางเมแทบอลิซึม ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีประโยชน์ในการสร้างตัวแทนบำบัดที่อาจใช้ได้สำหรับภาวะเช่น มะเร็ง การอักเสบ และโรคติดเชื้อ