ใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น อะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของสารประกอบสุดท้าย ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสร้างส่วนประกอบเภสัชภัณฑ์ที่ใช้งานได้ซึ่งมีคุณสมบัติต้านทานต่อการเผาผลาญที่ดีขึ้น ในด้านเกษตรเคมี มีส่วนช่วยในการผลิตยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชที่มีประสิทธิภาพสูงกว่าและความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาผลกระทบของฟลูออรีนต่อปฏิกิริยาระหว่างโมเลกุลและกิจกรรมทางชีวภาพ