ใช้หลักในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน (Boc-Asp-OMe) สำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์ กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนอัลฟา (alpha-amino group) ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่เฉพาะที่กรดคาร์บอกซิลิกอัลฟาที่เป็นอิสระได้ กรดคาร์บอกซิลิกของสายข้างได้รับการป้องกันเป็นเอสเตอร์เมทิล ซึ่งสามารถถูกฮีดรอลิซิสเลือกที่ได้ภายใต้สภาวะเบสิกหรือใช้ในปฏิกิริยาต่อไป ใช้อย่างแพร่หลายทั้งในสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็งและแบบสารละลายเพื่อสร้างชิ้นส่วนโปรตีนที่ซับซ้อน กลุ่มป้องกันที่ออร์โธกอนอลให้ความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาหลากหลาย ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ที่ต้องการการประกอบลำดับกรดอะมิโนอย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งเอนไซม์และโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรม