ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เพปไทด์แบบแข็ง โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ป้องกันแล้ว โดยเฉพาะสำหรับการนำหมู่เมธิโอนีนที่มีสเตอรีโอเคมีที่กำหนดมาใช้ หมู่ Fmoc ช่วยป้องกันแบบละลายด้วยเบสอ่อน ซึ่งเข้ากันได้กับการสังเคราะห์แบบเฟสแข็ง ช่วยให้สร้างเพปไทด์ได้ทีละขั้นตอนในเครื่องสังเคราะห์อัตโนมัติ หมู่ข้างเมธิโอนีน (เมธิลไทโอ) มอบคุณสมบัติไฮโดรโฟบิก ซึ่งช่วยให้เพปไทด์ที่ได้สามารถแทรกซึมเยื่อหุ้มเซลล์ได้ดี ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยเพื่อผลิตเพปไทด์ที่กำหนดเองสำหรับการพัฒนายา การทดสอบทางชีวเคมี การศึกษาโปรตีน การพัฒนาวัคซีน และสารยับยั้งเอนไซม์ ความบริสุทธิ์ทางคีรอลช่วยให้เพปไทด์ที่สังเคราะห์ได้มีการพับตัวและกิจกรรมทางชีวภาพที่ถูกต้อง