สารนี้ใช้เป็นตัวตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรม ซึ่งมีบทบาทในการป้องกันหมู่อะมิโนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง (solid-phase peptide synthesis) โครงสร้างที่มีหมู่ Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำให้สามารถลบหมู่ป้องกันได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน โดยไม่ทำลายพันธะเปปไทด์หรือหมู่ฟังก์ชันอื่น ๆ ที่ไวต่อสภาวะกรด ส่วนหมู่ฟลูออรีนบนวงแหวนอะโรมาติกช่วยเพิ่มความละลายตัวและเสถียรภาพของโมเลกุล ทำให้เหมาะสมกับการใช้ในระบบสังเคราะห์อัตโนมัติ นอกจากนี้ โครงสร้างที่มีศูนย์ไม่สมมาตร (chiral center) ยังช่วยควบคุมความเฉพาะเจาะจงของปฏิกิริยา ทำให้ได้ผลิตภัณฑ์เปปไทด์ที่มีความบริสุทธิ์และคุณภาพสูง เหมาะสำหรับการใช้ในงานพัฒนายาหรือโปรตีนจำลอง