ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์และสารประกอบที่มีโครงสร้างเป็นกรดอะมิโนอนุพันธ์ โดยเฉพาะในงานพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น ยาต้านไวรัส หรือยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาท โครงสร้างที่มีหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้ควบคุมทิศทางของปฏิกิริยาได้ดี และสามารถกำจัดหมู่ป้องกันนี้ออกได้ภายหลังโดยง่าย นิยมใช้ในสังเคราะห์แบบแข็ง (solid-phase synthesis) และในขั้นตอนการสร้างหน่วยย่อยของโมเลกุลยาที่ต้องการความบริสุทธิ์และเลือกจำเพาะสูง