ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์เปปไทด์และสารประกอบที่มีโครงสร้างอะมิโนกรดที่แก้ไขแล้ว โดยเฉพาะในงานพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ ส่วนของธีโอเฟนช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในไขมันและเพิ่มความเสถียรของโมเลกุล ทำให้เหมาะสำหรับการพัฒนายาที่ต้องผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ เช่น ยาต้านไวรัสหรือยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีเชิงชีวภาพเพื่อศึกษาการทำงานของเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการจำแนกจำเพาะของสารตั้งต้นที่มีโครงสร้างไม่ปกติ