ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยกรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกันแบบ N-Fmoc-N-methyl-L-cyclohexylalanine สำหรับการนำเข้าหมู่ hydrophobic ที่มี side chain แบบ cyclohexyl หมู่ Fmoc ให้การป้องกันที่ละลายได้ด้วยฐานอ่อน (base-labile) สำหรับหมู่ N-methyl alpha-amino ซึ่งเข้ากันได้กับการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (SPPS) ช่วยให้สามารถประกอบเปปไทด์แบบทีละขั้นตอนภายใต้สภาวะเบสโดยไม่กระทบต่อหมู่ฟังก์ชันที่ละเอียดอ่อนอื่นๆ

สเตอริโอเคมีแบบ S ที่คาร์บอนอัลฟา รับประกันความบริสุทธิ์ทางชิราล์ในเปปไทด์ที่ได้ ซึ่งสำคัญต่อกิจกรรมทางชีวภาพในงานเภสัชกรรม การมี N-methyl ช่วยเพิ่มความต้านทานต่อการย่อยสลายโดยเอนไซม์และปรับเปลี่ยนโครงสร้างคอนฟอร์เมชันและ bioavailability ของเปปไทด์

นิยมใช้ในการผลิตเปปไทด์บำบัด สารเคมีวิจัย และการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมของเปปไทด์ชีวภาพ