ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เพปไทด์แบบแข็ง โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อย (building block) ที่มีหมู่อะไซด์ (azide) ซึ่งสามารถนำไปใช้ต่อในปฏิกิริยาคลิกเคมี (click chemistry) โดยเฉพาะปฏิกิริยากับหมู่อัลไคน์ผ่านปฏิกิริยาไทริซาอีน (CuAAC) เพื่อสร้างโครงสร้างไตรอะโซลีน นิยมใช้ในการติดฉลากโมเลกุล การสร้างสารประกอบเชิงซ้อน หรือการวิจัยด้านโปรตีโอมิกส์ เนื่องจากหมู่ฟลูออเรน-9-มีทิล (Fmoc) ช่วยป้องกันหมู่เอไมน์ในระหว่างการสังเคราะห์ และสามารถถอดออกได้ง่ายด้วยพิเพอรีดีน ทำให้เหมาะกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอน