ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์และยาเลียนแบบเปปไทด์ โดยเฉพาะสารที่มีโครงสร้าง 2,3-ไดอะมิโนโพรพาโนอิกแอซิด ซึ่งความจำเพาะทางสเตอรีโอเคมีมีความสำคัญ กลุ่มปกป้อง Cbz บนหมู่อะมิโน β ในสายข้างช่วยให้สามารถทำการคัปปลิ้งแบบเลือกสรรผ่านหมู่อะมิโน α และกลุ่มคาร์บอกซิลที่เป็นอิสระในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็งและแบบสารละลาย นิยมใช้ในการผลิตยา เช่น ยายับยั้งโปรติเอสและยารักษาอื่นๆ ที่ต้องการความบริสุทธิ์ทางคีรัล กลุ่มเบนซิลคาร์บาเมต (Cbz) ให้ความเสถียรระหว่างปฏิกิริยาและสามารถกำจัดได้ภายใต้เงื่อนไขอ่อนโยน ทำให้เหมาะสำหรับการสังเคราะห์หลายขั้นตอน