ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นหน่วยย่อยของกรดอะมิโนที่ถูกป้องกัน โดยเฉพาะใน solid-phase synthesis กลุ่มแอซีโดช่วยให้สามารถปรับแต่งแบบเลือกสรรผ่าน click chemistry ซึ่งช่วยในการสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนหรือการเชื่อมต่อกับโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ กลุ่มฟลูออรีนิลเมท็อกซีคาร์บอนิล (Fmoc) ให้การป้องกัน N-terminal ชั่วคราวที่เข้ากันได้กับโปรโตคอล Fmoc-strategy มาตรฐาน โครงสร้างของมันสนับสนุนการรวมเข้าในห่วงโซ่เปปไทด์ซึ่งความสามารถของ side-chain สามารถถูกกระตุ้นในภายหลังผ่านการลดแอซีโดเป็นอะมีน ใช้กันทั่วไปในการพัฒนา bioconjugates ยาเปปไทด์ และวัสดุชีวภาพที่ถูกปรับแต่ง กลุ่มแอซีโดที่ตำแหน่ง 8 สามารถใช้ในการทำปฏิกิริยา click chemistry ร่วมกับหมู่อัลไคน์ผ่านปฏิกิริยา Huisgen cycloaddition เพื่อต่อเติมโมเลกุล เช่น ฟลูออเรสเซนต์แท็ก หรือโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ได้อย่างเฉพาะเจาะจง