ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์ทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการเตรียมตัวยับยั้งโปรติเอส ศูนย์ chiral และกลุ่มแอมิโนที่ถูกป้องกันทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง ซึ่งช่วยรักษาความสมบูรณ์ของสเตอริโอเคมีระหว่างปฏิกิริยาคัปปลิ้ง กลุ่ม fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) ช่วยให้สามารถกำจัดป้องกันภายใต้สภาวะอ่อนโยน ซึ่งเข้ากันได้กับลำดับเปปไทด์ที่ละเอียดอ่อน ใช้กันทั่วไปในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็งที่ต้องการสเตอริโอเคมีเฉพาะและหมู่ aromatic ที่ fluorinated เพื่อเพิ่มการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม