ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารชีวโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับกรดอะมิโนทริปโตเฟน โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรม เนื่องจากโครงสร้างที่มีหมู่อินโดลมีบทบาทสำคัญในการโต้ตอบกับตัวรับในระบบประสาท จึงนิยมใช้เป็นสารตั้งต้นในการพัฒนายาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาแก้ซึมเศร้า หรือยากดประสาท นอกจากนี้ยังใช้ในงานศึกษาชีววิทยาระดับโมเลกุลเพื่อติดตามหรือดัดแปลงโปรตีนที่มีการทำงานเกี่ยวข้องกับเส้นทางการสังเคราะห์เซโรโทนิน