ใช้เป็น chiral building block ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานเป็นเปปไทด์ หมู่ amine และ carboxylate ที่ได้รับการป้องกันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่แบบเลือกสรรได้ ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (solid-phase peptide synthesis) ใช้กันทั่วไปในการเตรียมตัวยับยั้งโปรติเอส (protease inhibitors) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ที่ stereochemistry มีความสำคัญ หมู่ Boc ที่ป้องกันกรดอะมิโนช่วยให้ความเสถียรระหว่างปฏิกิริยาและสามารถถอดการป้องกันได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้สามารถประกอบเปปไทด์ซับซ้อนแบบขั้นตอนทีละขั้น (stepwise assembly) ได้อย่างมีประสิทธิภาพ