ใช้เป็นตัวสร้างโครงสร้างแบบ chiral ในการสังเคราะห์ยาและสารชีวภาพที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ฟังก์ชันอัลไคน์ช่วยให้สามารถนำไปใช้ในปฏิกิริยา click chemistry โดยเฉพาะในงานค้นพบยาและพัฒนายาที่ใช้ฐานเปปไทด์ กลุ่มอะมีนหลักและกรดคาร์บอกซิลิกช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่สำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์ ใช้บ่อยในงานวิจัยเพื่อตรวจสอบกลไกของเอนไซม์หรือออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์ เนื่องจากมีโครงสร้างคล้ายกับกรดอะมิโนธรรมชาติแต่เพิ่ม reactivity จากพันธะทริปเปิลบอนด์