ใช้เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกันในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ ทำให้สามารถทำปฏิกิริยาคู่เลือกได้โดยไม่ถูกรบกวนจากสายข้าง กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ให้การป้องกันอะมีนที่ย้อนกลับได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ขณะที่เอสเตอร์เมทิลปกปิดกรดคาร์บอกซิลิกสำหรับการฮีดรอลิซิสหรือการกระตุ้นในภายหลัง ใช้กันอย่างแพร่หลายในกระบวนการประกอบเปปไทด์แบบเฟสของแข็งและแบบสารละลาย สนับสนุนการสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนแบบขั้นตอนด้วยความบริสุทธิ์และผลผลิตสูง นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรมและโมเลกุลชีวภาพที่ต้องการการควบคุมปฏิกิริยาของหมู่ฟังก์ชัน