ใช้หลักๆ ในกระบวนการสังเคราะห์เพปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน สารประกอบนี้ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาคัปปลิ้งแบบเลือกสรร เนื่องจากกลุ่ม Fmoc ซึ่งให้การป้องกันแบบออร์โธกอนัลสำหรับหน้าที่ของกลุ่มแอมิโน กลุ่มข้าง p-tolyl เพิ่มลักษณะ hydrophobic ซึ่งมีประโยชน์ในการปรับแต่งคุณสมบัติของเพปไทด์หรืออำนวยความสะดวกในการโต้ตอบเฉพาะเจาะจงในการสังเคราะห์แบบเฟสแข็ง มีคุณค่าอย่างยิ่งในการเตรียมเพปไทด์ที่มีโครงสร้างและเพปไทด์เลียนแบบ ซึ่ง aromaticity ของกลุ่มข้างมีอิทธิพลต่อการกำหนดทรงแบบหรือกิจกรรมทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในสภาพแวดล้อมการวิจัยสำหรับการค้นพบยาและโปรบทางชีวเคมี