ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในขั้นตอนที่ต้องการนำกลุ่มฟังก์ชันที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพเฉพาะตัวเข้าไปในโครงสร้างเปปไทด์ เนื่องจากมีหมู่ฟีนิลที่มีเบรอมีนแทนที่ในตำแหน่ง ortho ทำให้สามารถใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น สารยับยั้งเอนไซม์ หรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพอื่น ๆ ได้ หมู่ Fmoc ช่วยป้องกันไนโตรเจนของหมู่แอมิโนในระหว่างการสังเคราะห์ และสามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน ทำให้เหมาะสมกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียวในระบบอัตโนมัติ