6-อะมิโนเฮกซาโนอิกแอซิด ไฮโดรคลอไรด์ หรือที่รู้จักในชื่อ ε-อะมิโนคาโปรอิกแอซิด ไฮโดรคลอไรด์ ใช้หลักในทางการแพทย์เป็นยาต้านการสลายลิ่มเลือด (antifibrinolytic agent) เพื่อยับยั้งการสลายฟิบรินและป้องกันการเลือดออกมากเกินไป เช่น ในการผ่าตัด การรักษาโรคฮีโมฟีเลีย หรือภาวะเลือดออกอื่นๆ โดยให้ทางปากหรือฉีดเข้าหลอดเลือดดำ ในด้านเคมีสังเคราะห์ ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นที่หลากหลาย รวมถึงการเกิดเป็นวงแหวนเพื่อผลิตคาปโรแลคตัมสำหรับการผลิตไนลอน-6 ผ่านการพอลิเมอไรเซชันแบบเปิดวง ซึ่งสร้างโพลีเอไมด์ที่ใช้ในเส้นใย พลาสติก และวัสดุวิศวกรรม นอกจากนี้ หมู่อะมิโนและหมู่คาร์บอกซิลิกทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์ สารชีวภาพ และสารตั้งต้นเภสัชกรรม รูปแบบไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลายในน้ำและความเสถียรสำหรับทั้งการใช้ทางการแพทย์และการสังเคราะห์