3-(3-Pyridyl)-D-alanine ใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน โดยเฉพาะในบริบทของการเมแทบอลิซึมกรดอะมิโน ทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยในการสังเคราะห์เปปไทด์ ช่วยในการพัฒนาเปปไทด์ชนิดใหม่ที่มีศักยภาพในการประยุกต์ใช้ทางรักษา นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาระบบนิวโรทรานส미터 เพื่อช่วยทำความเข้าใจบทบาทของอนุพันธ์กรดอะมิโนในหน้าที่ทางระบบประสาท ความคล้ายคลึงทางโครงสร้างกับกรดอะมิโนตามธรรมชาติทำให้มีคุณค่าการสำรวจเส้นทางชีวภาพและการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์