1,3-Di-Boc-2-(2-Hydroxyethyl)Guanidine ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในด้านการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน ซึ่งสารนี้ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสร้างโครงสร้างทางเคมีที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในงานวิจัยทางเคมีอินทรีย์เพื่อพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในขั้นตอนการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันที่สำคัญระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้กระบวนการมีประสิทธิภาพและแม่นยำมากขึ้น