Ethyl N-Boc-oxamidate ใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับเอมีน โดยเฉพาะมีคุณค่ามากในเคมีเปปไทด์ ซึ่งช่วยปกป้องกลุ่มอะมิโนระหว่างปฏิกิริยาที่ซับซ้อน เพื่อให้มั่นใจในการปรับแต่งแบบเลือกสรรของกลุ่มฟังก์ชันอื่นๆ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมสารกลางสำหรับเภสัชภัณฑ์ ซึ่งช่วยให้การสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อนด้วยความแม่นยำสูง นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพ โดยความเสถียรและความง่ายในการกำจัดทำให้เป็นตัวเลือกที่เหมาะสมสำหรับการป้องกันฟังก์ชันเอมีนที่ละเอียดอ่อน