ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพและยา หมู่ไอโซอินโดลิน-1,3-ไดโอนทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันไนโตรเจน (protecting group) ช่วยควบคุมปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่ง ขณะที่โครงสร้าง 2-(2-เมทิล-1,3-ไดออกโซลาน-2-อิล)เอทิล เพิ่มความเข้ากันได้กับตัวทำละลายอินทรีย์และเสถียรภาพระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิกซับซ้อน ใช้อย่างแพร่หลายในการพัฒนาสารเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัลเนื่องจากความเสถียรและปฏิกิริยาใต้เงื่อนไขควบคุม นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีโพลิเมอร์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับมอนอเมอร์พิเศษ ช่วยออกแบบเรซินประสิทธิภาพสูงที่มีคุณสมบัติทางความร้อนและกลไกที่ปรับแต่งได้