ใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาสำคัญในสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการป้องกันวงอิมิโดซอลในเคมีนิวคลีโอไทด์และนิวคลีโอไซด์ การประยุกต์ใช้หลักคือในการเตรียมเบสเพียวรีนและไพรีมีดีนที่ถูกดัดแปลงสำหรับการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยกลุ่มไตรติลทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกัน และหมู่ไอโอโดช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมได้

นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็งที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างที่มีอิมิโดซอล ความสามารถในการป้องกันและกระตุ้นไนโตรเจนของอิมิโดซอลอย่างเลือกสรรทำให้มีคุณค่าต่อเส้นทางสังเคราะห์หลายขั้นตอนที่ต้องการความจำเพาะทาง regioselectivity สูง กลุ่มไตรฟีนิลเมทิล (Trityl) เป็นหมู่ป้องกันขนาดใหญ่และเสถียร สามารถกำจัดออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อนเพื่อคืนโครงสร้างอิมิโดซอลเดิม

นิยมใช้ในสังเคราะห์สารชีวภาพ เช่น นิวคลีโอไทด์ หรือสารประกอบที่มีโครงสร้างอิมิโดซอลเป็นส่วนสำคัญ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยาและการพัฒนาโมเลกุลที่ต้องการความจำเพาะสูง