N-Boc-1,6-hexanediamine ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมเปปไทด์และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยให้กลุ่มอะมีนที่ได้รับการป้องกันซึ่งสามารถถูกกำจัดป้องกันอย่างเลือกเฉพาะสำหรับปฏิกิริยาต่อไป สารเคมีนี้มีคุณค่าในการพัฒนายา โดยถูกใช้ในการสังเคราะห์ยาตัวสมัครและส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการผลิตโพลิเมอร์และเดนดริเมอร์ ซึ่งช่วยในการสร้างวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติเฉพาะ บทบาทของมันในสารไขว้ขวางยังทำให้มีประโยชน์ในการผสมตัวแทนกาว เคลือบ และเรซิน โดยรวมแล้ว N-Boc-1,6-hexanediamine เป็นบล็อกสร้างที่หลากหลายทั้งในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม