สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และเคมีเปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมีนในปฏิกิริยาเคมีที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการสังเคราะห์เปปไทด์และชีวโมเลกุลอื่นๆ กลุ่ม fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของสารประกอบนี้ ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) เนื่องจากความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ และความสามารถในการกำจัดออกอย่างเลือกสรรภายใต้สภาวะเบสอ่อน สิ่งนี้ทำให้มีคุณค่าอย่างสูงในการผลิตเปปไทด์สำหรับการวิจัยเภสัชกรรม การพัฒนายา และการศึกษาเชิงชีวเคมี นอกจากนี้ โมเลกุล hydroxyhexyl ยังช่วยเพิ่มความละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ สนับสนุนการนำไปใช้ในแอปพลิเคชันสังเคราะห์ที่หลากหลาย