สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นกลุ่มปกป้องสำหรับกลุ่มอะมีน ช่วยป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่พึงประสงค์ระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ เพื่อให้แน่ใจถึงลำดับที่ถูกต้องของกรดอะมิโนในโซ่เปปไทด์ กลุ่มฟลูออเรนิลเมทิลออกซิคาร์บอนิล (Fmoc) ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของสารประกอบนี้ มีคุณค่าอย่างยิ่งเนื่องจากมีความเสถียรภายใต้สภาวะเบสและกำจัดได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างเปปไทด์แบบขั้นตอนทีละขั้นด้วยความแม่นยำสูง นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ ที่ต้องการการปกป้องกลุ่มอะมีนแบบเลือกสรร