ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบเปปไทด์และสารประกอบที่มีโครงสร้างอะมิโนกรด โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างที่มีหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนอื่น ทำให้สามารถควบคุมการสังเคราะห์แบบเลือกได้ นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างสายเปปไทด์แบบแข็ง (solid-phase peptide synthesis) และการพัฒนายาที่ต้องการความเฉพาะเจาะจงสูง