ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมี โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารที่มีโครงสร้างของอะมิโน ซึ่งมีความสำคัญต่อการพัฒนายาในกลุ่มต่าง ๆ เช่น ยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง หรือสารที่มีฤทธิ์เป็นสารต้านอาการซึมเศร้า นิยมใช้ในขั้นตอนการป้องกันหมู่ฟังก์ชัน (protecting group) เนื่องจากหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) สามารถป้องกันหมู่อะมิโนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนอื่น และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้ควบคุมการสังเคราะห์ได้อย่างแม่นยำ