ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างเป็นแอมิโนหรือเพปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นหรือสารตัวกลางในการสร้างพันธะคาร์บาเมตหรือยูเรีย นิยมใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนาสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารยับยั้งเอนไซม์หรือสารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากกลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ช่วยป้องกันหมู่แอมิโนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนอื่น ทำให้ควบคุมทิศทางของปฏิกิริยาเคมีได้อย่างแม่นยำ