ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นตัวกลาง (intermediate) ในการผลิตยาที่มีโครงสร้างของแอนิลีนหรืออะมีนที่มีฟังก์ชันกลุ่มป้องกัน (protecting group) ซึ่งช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งในโมเลกุล นิยมใช้ในสังเคราะห์สารที่ต้องการความบริสุทธิ์สูง เช่น ยาต้านมะเร็ง ยาทางระบบประสาท หรือสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพอื่น ๆ เนื่องจากกลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) สามารถป้องกันกลุ่มอะมีนได้อย่างมีประสิทธิภาพและถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ๆ