เบนซิมิเดไมด์ไฮโดรคลอไรด์ไดไฮเดรตเป็นสารเคมีที่มีการใช้งานในหลายด้าน โดยเฉพาะในวงการเภสัชกรรมและงานวิจัยทางวิทยาศาสตร์ ใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ เช่น ยาต้านไวรัส ยาต้านเชื้อรา และยาต้านแบคทีเรีย นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและพัฒนายาใหม่ๆ ในห้องปฏิบัติการ เนื่องจากโครงสร้างโมเลกุลที่มีความเฉพาะเจาะจง ทำให้สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความปลอดภัยของยาได้