ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะเป็นตัวกลางสำคัญในการผลิตยาที่มีโครงสร้างไซโคลเฮกซิลที่มีหมู่อะมิโน ซึ่งมักพบในยาแก้ปวด ยาคลายกล้ามเนื้อ หรือสารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากกลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ช่วยเพิ่มความเลือกจำเพาะและเสถียรภาพของสารตัวกลาง ทำให้สามารถควบคุมปฏิกิริยาได้อย่างมีประสิทธิภาพ ก่อนจะถอดหมู่ป้องกันออกในขั้นตอนสุดท้าย